Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms