Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms