Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND1O60716 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms