Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHF1O43189 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms