Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC5O15511 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC5O15511 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms