Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLGNO14967 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLGNO14967 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLGNO14967 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLGNO14967 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLGNO14967 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms