Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
J3KT08 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
J3KT08 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
J3KT08 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
J3KT08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
J3KT08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
J3KT08 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
J3KT08 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
J3KT08 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
J3KT08 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms