Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DEV8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DEV8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DEV8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DEV8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DEV8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DEV8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DEV8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DEV8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms