Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms