Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms