Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL160290.1-201ENST00000415509 416 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC01012-204ENST00000629732 2771 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF259P1-202ENST00000572422 4912 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NFKB1-212ENST00000600343 4010 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms