Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms