Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms