Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH10Q9P2E7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms