Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms