Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms