Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms