Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT84Q9NSB2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms