Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR12Q9C0I1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR12Q9C0I1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms