Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPO4Q9C0E2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms