Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED18Q9BUE0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms