Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms