Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A3Q9BRY0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms