Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms