Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms