Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NSMCE2Q96MF7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms