Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C18orf8Q96DM3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms