Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CTTNBP2Q8WZ74 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CTTNBP2Q8WZ74 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms