Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms