Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms