Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM43BQ6ZT52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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