Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms