Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms