Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC102BQ68D86 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC102BQ68D86 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms