Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms