Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HABP4Q5JVS0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms