Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms