Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC2HC1CQ53FD0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC2HC1CQ53FD0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms