Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
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PTPAQ15257 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPAQ15257 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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