Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4AQ14139 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4AQ14139 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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