Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1CQ13936 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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