Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL4AQ13619 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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