Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CUL1Q13616 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CUL1Q13616 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CUL1Q13616 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CUL1Q13616 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CUL1Q13616 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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