Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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