Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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