Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIGFQ07326 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIGFQ07326 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms