Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms