Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms