Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRB1P82279 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRB1P82279 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms