Protein–RNA interactions for Protein: P80404

ABAT, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABATP80404 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ABATP80404 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABATP80404 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABATP80404 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABATP80404 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABATP80404 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABATP80404 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABATP80404 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABATP80404 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABATP80404 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms